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Deciphering the genetic interplay between depression and dysmenorrhea: a Mendelian randomization study
通过孟德尔随机化研究解析抑郁症与痛经之间的遗传交互作用
Shuhe Liu et al. Brief Bioinform. 2024.
机翻:
摘要
背景:本研究旨在通过结合多种资源的基因组学、转录组学和蛋白质交互数据,探索抑郁症与痛经之间的联系,采用综合且创新的方法。

方法:研究采用双样本、双向和多变量的孟德尔随机化(MR)方法,以确定痛经和抑郁症之间的因果关系。利用全基因组关联研究(GWAS)数据识别与痛经和抑郁症相关的遗传变异,并进行共享遗传影响的共定位分析。从公共数据库中分析表达数量性状基因座(eQTL)数据,以确定相关组织中的目标基因。此外,使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质交互(PPI)网络,分析已识别蛋白质之间的相互作用。

结果:MR分析证实抑郁症对痛经具有显著的因果影响([‘优势比’(95%置信区间)= 1.51(1.19, 1.91),P = 7.26 × 10⁻⁴])。相反,没有证据支持痛经对抑郁症具有因果影响(P = 0.74)。基于GWAS和eQTL数据的遗传分析发现了多个基因(包括GRK4、TRAIP和RNF123)的单核苷酸多态性,表明抑郁症可能通过这些遗传通路影响生殖功能,PPI网络分析进一步详细展示了这一点。共定位分析突出了rs34341246(RBMS3)作为一个潜在的共享因果变异位点。

结论:本研究表明,抑郁症对痛经具有显著影响,并识别出相关的关键基因和蛋白质。这些发现强调了在痛经女性中筛查抑郁症的重要性,并建议采用新的针对性预防策略,将基因组学和公共卫生相结合以改善临床实践。

关键词:孟德尔随机化;抑郁症;痛经;遗传学;基因组学;心理健康。

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/395921

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